Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39P62892 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl39P62892 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39P62892 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms