Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2lP62876 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2lP62876 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2lP62876 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2lP62876 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2lP62876 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2lP62876 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms