Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl18aP62717 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl18aP62717 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms