Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vbp1P61759 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vbp1P61759 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vbp1P61759 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vbp1P61759 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vbp1P61759 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vbp1P61759 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vbp1P61759 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vbp1P61759 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vbp1P61759 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vbp1P61759 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vbp1P61759 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vbp1P61759 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vbp1P61759 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vbp1P61759 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vbp1P61759 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vbp1P61759 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vbp1P61759 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vbp1P61759 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vbp1P61759 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vbp1P61759 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vbp1P61759 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vbp1P61759 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vbp1P61759 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vbp1P61759 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vbp1P61759 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vbp1P61759 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vbp1P61759 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms