Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp25P57080 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp25P57080 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp25P57080 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp25P57080 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp25P57080 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp25P57080 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp25P57080 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp25P57080 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp25P57080 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp25P57080 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp25P57080 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp25P57080 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms