Protein–RNA interactions for Protein: P56842

Tcl1b3, Protein TCL1B3, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b3P56842 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b3P56842 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b3P56842 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b3P56842 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcl1b3P56842 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms