Protein–RNA interactions for Protein: P55937

Golga3, Golgin subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Golga3P55937 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Golga3P55937 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Golga3P55937 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Golga3P55937 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Golga3P55937 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Golga3P55937 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Golga3P55937 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Golga3P55937 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Golga3P55937 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Golga3P55937 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Golga3P55937 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Golga3P55937 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Golga3P55937 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Golga3P55937 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Golga3P55937 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Golga3P55937 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Golga3P55937 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Golga3P55937 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Golga3P55937 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Golga3P55937 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Golga3P55937 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
Golga3P55937 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
Golga3P55937 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Golga3P55937 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Golga3P55937 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Golga3P55937 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Golga3P55937 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Golga3P55937 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Golga3P55937 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Golga3P55937 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Golga3P55937 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Golga3P55937 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Golga3P55937 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Golga3P55937 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Golga3P55937 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Golga3P55937 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Golga3P55937 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Golga3P55937 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Golga3P55937 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Golga3P55937 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Golga3P55937 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Golga3P55937 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Golga3P55937 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Golga3P55937 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Golga3P55937 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms