Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtskP55097 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtskP55097 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CtskP55097 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CtskP55097 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtskP55097 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CtskP55097 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtskP55097 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtskP55097 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtskP55097 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtskP55097 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtskP55097 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtskP55097 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CtskP55097 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtskP55097 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtskP55097 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtskP55097 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtskP55097 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtskP55097 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtskP55097 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtskP55097 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtskP55097 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtskP55097 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtskP55097 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtskP55097 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtskP55097 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtskP55097 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtskP55097 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtskP55097 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtskP55097 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtskP55097 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtskP55097 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtskP55097 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtskP55097 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtskP55097 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtskP55097 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtskP55097 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtskP55097 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtskP55097 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtskP55097 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtskP55097 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtskP55097 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtskP55097 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtskP55097 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtskP55097 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtskP55097 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtskP55097 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtskP55097 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtskP55097 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtskP55097 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtskP55097 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtskP55097 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtskP55097 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtskP55097 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtskP55097 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtskP55097 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtskP55097 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtskP55097 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtskP55097 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtskP55097 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtskP55097 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtskP55097 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtskP55097 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtskP55097 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtskP55097 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtskP55097 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtskP55097 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtskP55097 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtskP55097 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtskP55097 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtskP55097 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtskP55097 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtskP55097 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtskP55097 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtskP55097 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtskP55097 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtskP55097 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtskP55097 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtskP55097 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtskP55097 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtskP55097 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtskP55097 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms