Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc12a1P55014 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc12a1P55014 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc12a1P55014 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc12a1P55014 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc12a1P55014 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc12a1P55014 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc12a1P55014 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms