Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
StomP54116 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
StomP54116 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
StomP54116 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
StomP54116 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
StomP54116 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
StomP54116 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
StomP54116 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StomP54116 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
StomP54116 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
StomP54116 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
StomP54116 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StomP54116 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StomP54116 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StomP54116 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
StomP54116 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StomP54116 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
StomP54116 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StomP54116 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StomP54116 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StomP54116 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
StomP54116 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StomP54116 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StomP54116 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StomP54116 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StomP54116 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StomP54116 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
StomP54116 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
StomP54116 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StomP54116 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
StomP54116 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
StomP54116 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
StomP54116 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StomP54116 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StomP54116 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
StomP54116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
StomP54116 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
StomP54116 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
StomP54116 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
StomP54116 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
StomP54116 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StomP54116 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StomP54116 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StomP54116 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StomP54116 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StomP54116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StomP54116 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
StomP54116 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
StomP54116 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
StomP54116 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
StomP54116 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
StomP54116 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
StomP54116 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
StomP54116 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
StomP54116 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
StomP54116 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
StomP54116 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
StomP54116 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
StomP54116 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
StomP54116 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
StomP54116 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
StomP54116 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
StomP54116 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
StomP54116 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
StomP54116 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
StomP54116 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
StomP54116 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
StomP54116 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms