Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhox5P52651 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhox5P52651 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox5P52651 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox5P52651 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rhox5P52651 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox5P52651 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhox5P52651 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 622.8 ms