Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc4P51655 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc4P51655 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc4P51655 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms