Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl9P51410 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl9P51410 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl9P51410 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9P51410 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpl9P51410 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9P51410 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9P51410 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9P51410 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms