Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tnnt2P50752 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnnt2P50752 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt2P50752 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt2P50752 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms