Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Defa11P50709 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms