Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa11P50709 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Defa11P50709 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Defa11P50709 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Defa11P50709 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa11P50709 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa11P50709 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa11P50709 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms