Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnni3P48787 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnni3P48787 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnni3P48787 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnni3P48787 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnni3P48787 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnni3P48787 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnni3P48787 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms