Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tdo2P48776 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tdo2P48776 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tdo2P48776 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tdo2P48776 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tdo2P48776 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tdo2P48776 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tdo2P48776 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tdo2P48776 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tdo2P48776 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdo2P48776 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdo2P48776 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms