Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45aP48316 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gadd45aP48316 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gadd45aP48316 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms