Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms