Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm5cP41230 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm5cP41230 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Kdm5cP41230 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5cP41230 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5cP41230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5cP41230 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm5cP41230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5cP41230 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms