Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbl1P39039 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbl1P39039 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbl1P39039 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbl1P39039 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms