Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PtprkP35822 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PtprkP35822 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PtprkP35822 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprkP35822 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprkP35822 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PtprkP35822 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PtprkP35822 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PtprkP35822 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprkP35822 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PtprkP35822 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PtprkP35822 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprkP35822 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PtprkP35822 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PtprkP35822 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PtprkP35822 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PtprkP35822 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms