Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab20P35295 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab20P35295 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab20P35295 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab20P35295 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab20P35295 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab20P35295 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab20P35295 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab20P35295 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab20P35295 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab20P35295 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab20P35295 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab20P35295 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab20P35295 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab20P35295 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab20P35295 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab20P35295 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab20P35295 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms