Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp13P33435 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp13P33435 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp13P33435 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms