Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdh15P33146 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdh15P33146 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdh15P33146 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh15P33146 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh15P33146 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh15P33146 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms