Protein–RNA interactions for Protein: P29621

Serpina3c, Serine protease inhibitor A3C, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina3cP29621 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina3cP29621 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Serpina3cP29621 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3cP29621 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Serpina3cP29621 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serpina3cP29621 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpina3cP29621 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpina3cP29621 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms