Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HexaP29416 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HexaP29416 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HexaP29416 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HexaP29416 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HexaP29416 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HexaP29416 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HexaP29416 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HexaP29416 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HexaP29416 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HexaP29416 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HexaP29416 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexaP29416 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HexaP29416 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HexaP29416 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HexaP29416 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HexaP29416 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HexaP29416 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HexaP29416 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HexaP29416 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HexaP29416 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HexaP29416 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HexaP29416 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HexaP29416 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HexaP29416 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HexaP29416 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HexaP29416 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HexaP29416 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HexaP29416 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HexaP29416 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HexaP29416 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HexaP29416 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HexaP29416 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HexaP29416 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HexaP29416 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HexaP29416 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HexaP29416 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HexaP29416 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HexaP29416 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HexaP29416 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HexaP29416 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HexaP29416 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HexaP29416 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HexaP29416 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HexaP29416 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HexaP29416 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HexaP29416 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HexaP29416 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HexaP29416 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HexaP29416 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HexaP29416 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HexaP29416 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HexaP29416 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HexaP29416 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HexaP29416 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HexaP29416 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HexaP29416 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HexaP29416 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HexaP29416 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HexaP29416 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HexaP29416 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HexaP29416 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HexaP29416 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HexaP29416 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HexaP29416 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HexaP29416 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HexaP29416 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HexaP29416 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HexaP29416 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HexaP29416 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HexaP29416 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HexaP29416 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HexaP29416 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HexaP29416 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HexaP29416 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HexaP29416 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexaP29416 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HexaP29416 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HexaP29416 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HexaP29416 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HexaP29416 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HexaP29416 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms