Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpl3P27659 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3P27659 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl3P27659 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3P27659 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms