Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd7P26516 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd7P26516 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd7P26516 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd7P26516 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd7P26516 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd7P26516 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd7P26516 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd7P26516 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd7P26516 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd7P26516 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd7P26516 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd7P26516 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd7P26516 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd7P26516 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd7P26516 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd7P26516 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd7P26516 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd7P26516 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd7P26516 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd7P26516 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd7P26516 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd7P26516 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd7P26516 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd7P26516 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd7P26516 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd7P26516 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmd7P26516 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms