Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmo2P25801 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmo2P25801 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmo2P25801 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmo2P25801 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmo2P25801 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmo2P25801 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmo2P25801 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmo2P25801 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmo2P25801 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmo2P25801 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmo2P25801 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo2P25801 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms