Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms