Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhrP21761 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhrP21761 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhrP21761 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhrP21761 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhrP21761 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhrP21761 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhrP21761 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhrP21761 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhrP21761 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrhrP21761 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrhrP21761 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhrP21761 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrhrP21761 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhrP21761 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrhrP21761 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhrP21761 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrhrP21761 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhrP21761 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrhrP21761 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms