Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BdnfP21237 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BdnfP21237 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BdnfP21237 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BdnfP21237 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BdnfP21237 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BdnfP21237 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BdnfP21237 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BdnfP21237 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BdnfP21237 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BdnfP21237 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BdnfP21237 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BdnfP21237 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BdnfP21237 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms