Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
P20040 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
P20040 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P20040 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
P20040 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P20040 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P20040 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P20040 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P20040 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P20040 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
P20040 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P20040 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P20040 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P20040 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms