Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp53P15975 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp53P15975 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp53P15975 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp53P15975 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp53P15975 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp53P15975 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp53P15975 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp53P15975 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp53P15975 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms