Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf1P15314 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf1P15314 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf1P15314 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf1P15314 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf1P15314 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf1P15314 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf1P15314 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf1P15314 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf1P15314 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf1P15314 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf1P15314 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf1P15314 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Irf1P15314 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf1P15314 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf1P15314 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf1P15314 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf1P15314 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf1P15314 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf1P15314 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf1P15314 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf1P15314 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf1P15314 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf1P15314 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf1P15314 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf1P15314 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf1P15314 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf1P15314 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf1P15314 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf1P15314 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf1P15314 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf1P15314 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf1P15314 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf1P15314 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf1P15314 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf1P15314 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms