Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpsaP14206 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpsaP14206 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpsaP14206 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpsaP14206 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpsaP14206 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RpsaP14206 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms