Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnp2P11378 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnp2P11378 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnp2P11378 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnp2P11378 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnp2P11378 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnp2P11378 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnp2P11378 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnp2P11378 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnp2P11378 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnp2P11378 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnp2P11378 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnp2P11378 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnp2P11378 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnp2P11378 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnp2P11378 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnp2P11378 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnp2P11378 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnp2P11378 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnp2P11378 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnp2P11378 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnp2P11378 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnp2P11378 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnp2P11378 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnp2P11378 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms