Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd4P10628 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4P10628 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd4P10628 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms