Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254bP0DN90 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem254bP0DN90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254bP0DN90 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem254bP0DN90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem254bP0DN90 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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