Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amd1P0DMN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amd1P0DMN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amd1P0DMN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Amd1P0DMN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amd1P0DMN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Amd1P0DMN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms