Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb8P09632 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb8P09632 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb8P09632 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb8P09632 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb8P09632 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb8P09632 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms