Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckP09240 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckP09240 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckP09240 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckP09240 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckP09240 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckP09240 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckP09240 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckP09240 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckP09240 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckP09240 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckP09240 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckP09240 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckP09240 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckP09240 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckP09240 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckP09240 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckP09240 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckP09240 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckP09240 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckP09240 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckP09240 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckP09240 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckP09240 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckP09240 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckP09240 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckP09240 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckP09240 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckP09240 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckP09240 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckP09240 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckP09240 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CckP09240 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckP09240 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckP09240 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckP09240 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckP09240 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckP09240 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckP09240 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms