Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd3P09027 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd3P09027 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd3P09027 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd3P09027 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd3P09027 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd3P09027 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd3P09027 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd3P09027 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd3P09027 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms