Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gap43P06837 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gap43P06837 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gap43P06837 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gap43P06837 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gap43P06837 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gap43P06837 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gap43P06837 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gap43P06837 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gap43P06837 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gap43P06837 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms