Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9P06683 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9P06683 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9P06683 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9P06683 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9P06683 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9P06683 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9P06683 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9P06683 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9P06683 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9P06683 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9P06683 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9P06683 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9P06683 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9P06683 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9P06683 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9P06683 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9P06683 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9P06683 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9P06683 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9P06683 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9P06683 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9P06683 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9P06683 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9P06683 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9P06683 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9P06683 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9P06683 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9P06683 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9P06683 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9P06683 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9P06683 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9P06683 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9P06683 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9P06683 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9P06683 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9P06683 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9P06683 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C9P06683 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9P06683 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9P06683 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9P06683 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9P06683 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9P06683 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9P06683 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9P06683 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9P06683 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9P06683 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9P06683 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9P06683 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9P06683 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9P06683 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9P06683 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9P06683 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9P06683 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9P06683 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9P06683 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9P06683 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9P06683 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9P06683 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9P06683 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9P06683 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9P06683 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9P06683 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C9P06683 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9P06683 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9P06683 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9P06683 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9P06683 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9P06683 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9P06683 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9P06683 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9P06683 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9P06683 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9P06683 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9P06683 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9P06683 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9P06683 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9P06683 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9P06683 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9P06683 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9P06683 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9P06683 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9P06683 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9P06683 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9P06683 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9P06683 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9P06683 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9P06683 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms