Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myl1P05977 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl1P05977 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl1P05977 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myl1P05977 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myl1P05977 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl1P05977 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl1P05977 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Myl1P05977 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl1P05977 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Myl1P05977 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myl1P05977 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myl1P05977 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myl1P05977 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myl1P05977 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myl1P05977 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myl1P05977 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myl1P05977 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myl1P05977 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myl1P05977 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myl1P05977 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms