Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a1P04919 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc4a1P04919 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slc4a1P04919 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc4a1P04919 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc4a1P04919 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc4a1P04919 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc4a1P04919 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc4a1P04919 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc4a1P04919 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc4a1P04919 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a1P04919 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc4a1P04919 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc4a1P04919 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms