Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01745 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01745 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01745 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01745 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01745 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01745 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01745 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01745 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01745 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01745 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01745 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01745 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01745 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01745 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01745 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01745 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01745 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01745 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01745 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01745 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01745 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01745 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01745 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01745 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01745 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01745 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01745 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01745 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01745 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01745 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01745 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01745 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01745 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P01745 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01745 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01745 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01745 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01745 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01745 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01745 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01745 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01745 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01745 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01745 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01745 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01745 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01745 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01745 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01745 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01745 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01745 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01745 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01745 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01745 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01745 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01745 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01745 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01745 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01745 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01745 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01745 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01745 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01745 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms