Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P01734 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
P01734 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01734 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01734 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01734 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01734 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01734 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01734 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01734 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
P01734 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
P01734 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P01734 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P01734 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P01734 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01734 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01734 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01734 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
P01734 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01734 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01734 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01734 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01734 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P01734 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01734 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01734 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01734 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01734 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01734 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01734 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01734 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
P01734 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01734 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P01734 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P01734 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01734 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01734 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01734 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01734 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01734 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01734 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01734 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P01734 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P01734 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P01734 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P01734 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01734 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
P01734 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
P01734 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01734 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01734 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01734 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
P01734 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01734 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01734 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01734 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01734 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
P01734 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01734 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01734 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01734 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01734 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01734 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01734 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01734 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01734 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01734 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01734 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01734 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
P01734 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
P01734 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01734 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01734 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P01734 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01734 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01734 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01734 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01734 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P01734 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P01734 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P01734 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P01734 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01734 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01734 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01734 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
P01734 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01734 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01734 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01734 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01734 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01734 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01734 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01734 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P01734 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms