Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Odc1P00860 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Odc1P00860 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Odc1P00860 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Odc1P00860 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Odc1P00860 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odc1P00860 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Odc1P00860 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Odc1P00860 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odc1P00860 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odc1P00860 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Odc1P00860 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odc1P00860 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odc1P00860 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Odc1P00860 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Odc1P00860 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odc1P00860 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odc1P00860 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odc1P00860 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odc1P00860 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odc1P00860 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Odc1P00860 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Odc1P00860 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odc1P00860 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms